170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3028 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.84 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  45.36 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.15 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.66 
 
 		 198 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.96 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  52.11 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  45.12 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  43.16 
 
 		 172 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  50.7 
 
 		 178 aa  84  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.09 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  41.24 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.14 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.14 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  50 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  41.18 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  43.66 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.82 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.19 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  37.29 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  43.3 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  42.31 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  40.22 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  43.53 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  34.15 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.48 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  46.97 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  48.78 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.36 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  46.48 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  39.13 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  39.13 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  35.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.73 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.69 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  33.86 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  44.83 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.33 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  45.45 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  38.2 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.25 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  24.11 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  39.33 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  39.06 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  40.62 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  43.75 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.21 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  31.16 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  30.47 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  31.16 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.42 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  31.16 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  37.65 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  37.65 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  43.75 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  43.75 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  34.88 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  34.43 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  27.82 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  33.72 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  33.72 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.86 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  42.19 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  33.72 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.68 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  39.06 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  31.96 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.38 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  29.2 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  34.31 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.36 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.48 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  28.67 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  39.06 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.94 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 		 96 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  36.36 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  27.59 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.87 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  34.38 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.58 
 
 		 102 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  40.48 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>