204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0319 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  63.37 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  63.54 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  61.22 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  60.42 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.08 
 
 		 99 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  58.16 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.74 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.12 
 
 		 197 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.08 
 
 		 203 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  51.52 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  48.96 
 
 		 179 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  50 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  48.48 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  48.48 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  48.48 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  48.48 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  48.96 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  42.2 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  53.06 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.16 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.31 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.2 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.87 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.77 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.77 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.41 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.18 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  50.42 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  57 
 
 		 132 aa  95.9  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.12 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.38 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.12 
 
 		 171 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.92 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.12 
 
 		 171 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.92 
 
 		 188 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  55.56 
 
 		 220 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.56 
 
 		 220 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.19 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.02 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.15 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.52 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  34.78 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  33.61 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  43.66 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.37 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  39.39 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.88 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  44.07 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  44.07 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  32.73 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  28.46 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  29.41 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  28.24 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  34.62 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  30.65 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  31.18 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  45 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  27.01 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.19 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  34.41 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  44.26 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  45.76 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  44.26 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.35 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  26.96 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  38.24 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.26 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  25.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  34.52 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  34.52 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.71 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  25.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  25.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  25.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  44.64 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  27.13 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  27.13 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  27.13 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  26.28 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  31.18 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2611  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.78 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  44.64 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  44.64 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>