202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03679 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  100 
 
 
171 aa  343  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  99.42 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  82.94 
 
 
182 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  82.94 
 
 
182 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  82.94 
 
 
182 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  82.94 
 
 
182 aa  276  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  82.35 
 
 
182 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  78.12 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.74 
 
 
197 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.36 
 
 
203 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  64.67 
 
 
220 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  64.67 
 
 
220 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  75.59 
 
 
188 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  69.29 
 
 
190 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  56.52 
 
 
184 aa  141  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.96 
 
 
187 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  58.14 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  57.84 
 
 
125 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  55.21 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  59.78 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  51.52 
 
 
132 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  51.04 
 
 
132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  50 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  51.02 
 
 
133 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.59 
 
 
147 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.59 
 
 
147 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 
171 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 
171 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.03 
 
 
166 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 
166 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 
99 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.14 
 
 
158 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  51.3 
 
 
149 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.54 
 
 
147 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.05 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  59.79 
 
 
132 aa  98.6  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.14 
 
 
134 aa  97.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.1 
 
 
132 aa  97.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.67 
 
 
132 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.48 
 
 
131 aa  91.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  45.83 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  38.14 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  41 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.78 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.68 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.36 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  27.67 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.38 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  33.8 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  30.09 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  29.73 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.14 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  32.63 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  31.4 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  32.41 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  31.52 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  32.61 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  35.16 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.02 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  28.92 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  32.29 
 
 
120 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.89 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.18 
 
 
116 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 
117 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  26.14 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.09 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  35 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  37.5 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  28.73 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  38.33 
 
 
118 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.48 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.89 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.11 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.67 
 
 
126 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  35 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.84 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  27.56 
 
 
142 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.1 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  29.79 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.3 
 
 
96 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  28.35 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.94 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  56.1 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.94 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  27.67 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0220  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.02 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  37.97 
 
 
129 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>