165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1181 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  73.2 
 
 		 160 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  73.33 
 
 		 155 aa  223  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  69.18 
 
 		 159 aa  221  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  67.48 
 
 		 165 aa  216  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  68.29 
 
 		 164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  69.08 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  62.99 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  59.17 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  53.57 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  56.33 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  54.72 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  55.06 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  50 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  50 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  50 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  56.33 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  53.21 
 
 		 170 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  53.21 
 
 		 170 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  50 
 
 		 175 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  50 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  51.52 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  50.6 
 
 		 175 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  50.6 
 
 		 175 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  50.6 
 
 		 175 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  50 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  50.58 
 
 		 182 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  49.4 
 
 		 175 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  49.4 
 
 		 175 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  49.4 
 
 		 175 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  49.4 
 
 		 175 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  50.3 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  50.91 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  44.74 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  43.42 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  61.04 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  46.55 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.23 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  40.35 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  46.07 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.64 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  40.18 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  50.82 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.68 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  45.16 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  45.9 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.9 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  41.25 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.1 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.63 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  38.75 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.62 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  39.71 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.24 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  43.84 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.24 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  40.51 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.01 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.89 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.24 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  34.48 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  38.24 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.63 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.68 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.84 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  41.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  36.46 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.03 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  43.1 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.11 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.07 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.81 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  34.07 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  39.39 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  28.57 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  40.51 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.36 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2611  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.58 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.21 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.45 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.36 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  41.82 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  26.73 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.36 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>