201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4361 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  98.9 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  81.87 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  81.32 
 
 		 171 aa  284  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  86.01 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  79.25 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.35 
 
 		 203 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  61.33 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.33 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  81.63 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  69.33 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  66.67 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  63.64 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  54.55 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  55.88 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  54.64 
 
 		 125 aa  121  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  50 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  54.37 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  50.52 
 
 		 132 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  38.55 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  48.98 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.48 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.61 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.61 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.78 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.78 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.96 
 
 		 99 aa  104  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.78 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  53.04 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.14 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.9 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.21 
 
 		 132 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.54 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.43 
 
 		 134 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  48.8 
 
 		 132 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.43 
 
 		 132 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.61 
 
 		 132 aa  94.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.5 
 
 		 131 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  41.41 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  45.35 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.24 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.63 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.53 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  35.11 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  30.97 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  33.87 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  33.7 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.08 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  30.63 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  32.61 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  32.61 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.53 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.21 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.94 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  33.78 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.74 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  38.81 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.34 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  30.12 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  38.75 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.09 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  28 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.97 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  32.5 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.62 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.1 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  25.93 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  32.5 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 96 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.75 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  56.1 
 
 		 110 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  25.14 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  27.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  27.5 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  25.21 
 
 		 132 aa  52  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.14 
 
 		 88 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  36.92 
 
 		 104 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>