197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0441 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
166 aa  333  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  98.19 
 
 
166 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  96.49 
 
 
171 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  96.49 
 
 
171 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.24 
 
 
158 aa  225  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  77.11 
 
 
147 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  77.11 
 
 
147 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  76.51 
 
 
147 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  84.26 
 
 
125 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  76.05 
 
 
149 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  72.39 
 
 
131 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  90.1 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  77.24 
 
 
132 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  89.11 
 
 
132 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  72.39 
 
 
134 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  84.16 
 
 
132 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  55.65 
 
 
132 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  60 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  55 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  43.03 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  51.28 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  51.28 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  51.28 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  51.28 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  51.28 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  61.86 
 
 
133 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  50.43 
 
 
179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.73 
 
 
203 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.14 
 
 
99 aa  121  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.21 
 
 
190 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.38 
 
 
136 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  45.8 
 
 
157 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  60.42 
 
 
102 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  43.57 
 
 
184 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.46 
 
 
188 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.94 
 
 
220 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  52.94 
 
 
220 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  54 
 
 
99 aa  94  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.46 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 
151 aa  84.3  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.04 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  31.95 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  30.57 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  43.75 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.38 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  34.41 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  43.48 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  40.23 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 
254 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.96 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  33.05 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  34.17 
 
 
132 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.31 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  28.57 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  39.34 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.18 
 
 
208 aa  58.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.62 
 
 
117 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  35.71 
 
 
194 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41.67 
 
 
120 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  34.29 
 
 
179 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  40.3 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  29.82 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.14 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  35.71 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.1 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  37.5 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  40.3 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  35.82 
 
 
200 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.81 
 
 
189 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.88 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  25.32 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  35 
 
 
137 aa  53.9  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  35.82 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  31.09 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  33.68 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  38.81 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  34.57 
 
 
104 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  31.09 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  31.09 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.27 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.1 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  32.61 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>