146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3829 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  100 
 
 		 179 aa  347  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  60.75 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  59.52 
 
 		 123 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  56.96 
 
 		 105 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.49 
 
 		 102 aa  94  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.25 
 
 		 120 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  46.9 
 
 		 112 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 129 aa  87.8  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.43 
 
 		 120 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  42.22 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.44 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.33 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.65 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  29.95 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  29.95 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  29.95 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  55.17 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  34.93 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  41.57 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.25 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.67 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  45.68 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.71 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  50 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  30 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.14 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  31.46 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  30.23 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  35.86 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  45.16 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.18 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.1 
 
 		 115 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.18 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  37.18 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.18 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.64 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  42.25 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.18 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.78 
 
 		 128 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.87 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  39.29 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  28.75 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.4 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  35.8 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  34.55 
 
 		 96 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  34.48 
 
 		 88 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  33.85 
 
 		 132 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.9 
 
 		 89 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.85 
 
 		 132 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.43 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 88 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.81 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  36.36 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  29.82 
 
 		 96 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.82 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  37.1 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.18 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.55 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  29.82 
 
 		 95 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.45 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  35.19 
 
 		 91 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  31.37 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  34.55 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  34.55 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  34.55 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.21 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  35.42 
 
 		 95 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 		 96 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 99 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  32.61 
 
 		 55 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.36 
 
 		 118 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>