120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0798 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  100 
 
 		 129 aa  263  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  54.01 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  43.26 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  41.61 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  41.61 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  41.61 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  42.07 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.17 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  39.32 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.04 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  34.35 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  41.43 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.69 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.56 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  30.23 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  31.34 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  33.7 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.77 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  33.72 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.97 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  36.25 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.09 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  32.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 197 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  34.55 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  32 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  30.43 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  40 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.09 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.09 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.47 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  30.99 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.76 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  34.38 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.06 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  26.17 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  26.61 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.77 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.98 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.69 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  33.85 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  33.82 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.1 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  32.91 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.09 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.77 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.77 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.44 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  26.14 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  38.18 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  48.78 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.59 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  31.58 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  28.92 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  32.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  28.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  31.51 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  41.94 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  34.38 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.34 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  27.83 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.18 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  30.38 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  34.15 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  27.83 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.41 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  26.53 
 
 		 142 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.56 
 
 		 208 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  38.1 
 
 		 84 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>