84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1187 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  56.3 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  54.47 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.67 
 
 
120 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.58 
 
 
102 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  48.33 
 
 
179 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  43.7 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  59.49 
 
 
194 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  41.04 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  35.77 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.86 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  36.13 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.59 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  41.67 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  35.46 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  32.86 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  48.81 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  32.86 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  32.86 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  47.56 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  39.68 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.23 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.45 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  34.51 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.43 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.94 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  39.68 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  34.26 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.31 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.78 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.58 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  28.57 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  28.57 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  28.57 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.6 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  31.25 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  30.28 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  30.28 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  30.28 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  30.28 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.86 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  31.86 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.12 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  26.67 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  30.77 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
234 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  28.87 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.15 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.3 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.07 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  31.67 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.86 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  31.67 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  34.44 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.79 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  38.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  34.94 
 
 
179 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  34.44 
 
 
175 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  35.21 
 
 
188 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  34.44 
 
 
176 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  34.94 
 
 
179 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  34.94 
 
 
179 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  34 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  29.63 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  33.8 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  25.44 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  34.74 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  30.84 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  33.8 
 
 
200 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  33.8 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  34.74 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  33.33 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>