91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0814 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  100 
 
 
141 aa  283  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  62.64 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  61.9 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.7 
 
 
134 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.52 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  41.96 
 
 
137 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.36 
 
 
127 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  49.4 
 
 
202 aa  99.4  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.71 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  51.19 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  35.37 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  34.04 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  33.33 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  47.46 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.18 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.62 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.65 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  36.47 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.17 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.29 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  26.53 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  35.21 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  30 
 
 
194 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  37.08 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  27.41 
 
 
162 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  29.05 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  29.05 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  42.59 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  43.64 
 
 
130 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  29.05 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  36.62 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  28.97 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 
208 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
234 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.43 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  29 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.58 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  33.71 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  36.07 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  37.5 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  37.5 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.29 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.37 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  34.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  38.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  36.07 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  34.43 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  34.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  34.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  34.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  34.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  38.89 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.19 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.46 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.74 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  35.29 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.48 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.74 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  27.78 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  33.33 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.02 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  25.88 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  31.43 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  35.19 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  30 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.73 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.87 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  32.31 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  26.83 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  31.4 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.09 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.87 
 
 
146 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>