144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1600 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  100 
 
 
96 aa  189  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  92.71 
 
 
96 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  92.71 
 
 
95 aa  147  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  41.67 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.22 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  35 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.14 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  35.82 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.06 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  36.07 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  38.6 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  36.07 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.76 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  31.17 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  35.09 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.29 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.88 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  25.58 
 
 
111 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.89 
 
 
106 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  31.58 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.76 
 
 
96 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  34.85 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  32.1 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  26.32 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  33.73 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  25.97 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.84 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  32 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  45.28 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  33.73 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.21 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  33.93 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.85 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.72 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  24.44 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  32.14 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.82 
 
 
214 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  32.14 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  36.54 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.32 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.21 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  28.4 
 
 
132 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.03 
 
 
89 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  31.25 
 
 
77 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
61 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  34.57 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.25 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  33.33 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.25 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.61 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  36.73 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  25 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  31.75 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.25 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  25.27 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  31.75 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.58 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  30.36 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  29.82 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  41.86 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.36 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  28.07 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  44.44 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  34.55 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.21 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
200 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.81 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  31.58 
 
 
188 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  29.09 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  35.19 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.75 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  45.65 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.09 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  39.58 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.74 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  28.57 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>