167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3837 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  39.47 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  57.63 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.46 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.49 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  39.56 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.33 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.16 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.02 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  40.79 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  62.86 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.56 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
56 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  46.94 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.34 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  47.06 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  37.65 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  52.38 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  55.26 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.97 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  47.27 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  51.28 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 
95 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  45.28 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.26 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  46.94 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  51.11 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  52.63 
 
 
71 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  51.11 
 
 
98 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
122 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.77 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.1 
 
 
155 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.27 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.06 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.43 
 
 
189 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  37.66 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.22 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.26 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  47.17 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  38.67 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.26 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.99 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.26 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  67.74 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.81 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.26 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  67.74 
 
 
71 aa  47.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.14 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.91 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.89 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  36.21 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  38.89 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.3 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  44.19 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  51.28 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.04 
 
 
207 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
139 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
139 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  36.21 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.55 
 
 
122 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  51.22 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  35 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  35 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  41.18 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  51.22 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  41.82 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>