263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1469 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  100 
 
 		 126 aa  249  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.2 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  67.78 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.75 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.15 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.39 
 
 		 193 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  63.24 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  45.61 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.97 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.79 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  51.56 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  50.75 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  43.18 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  43.18 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  54.1 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.05 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.31 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  42.86 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  44 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.7 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.79 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  49.21 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.79 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  44.29 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.46 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  50.98 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  49.09 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  41.33 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.78 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.28 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.59 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  36.08 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.1 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.64 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  53.19 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  35.42 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  34.62 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.06 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  43.94 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  43.94 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  50.98 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  51.06 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  43.28 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  36.04 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  38.57 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.64 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  52 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  40 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  44 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  40 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  40 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  40 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  40 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.78 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  43.08 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  41.27 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  36.14 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  44 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.28 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.81 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  44 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  32.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.66 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  35.71 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.1 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.06 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  36.54 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  46.81 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.9 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  44 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.66 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  39.68 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>