256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3124 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.68 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  67.78 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  90.2 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.41 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.16 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  53.73 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.59 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  56.9 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.21 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  43.55 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  36.08 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  56.86 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  44.16 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  46.88 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  34.19 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  57.45 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  55.32 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.51 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.73 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  50.98 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50.91 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.85 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.73 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  42.65 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.29 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  37.31 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  44.93 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.96 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.21 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.33 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  50.94 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  51.06 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  35.63 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.74 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  37.14 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  49.09 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  47.17 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.13 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.13 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.71 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  49.02 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.64 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  41.94 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  40.98 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  45.1 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  29.17 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.23 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  34.33 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  41.79 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  41.79 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  37.88 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  35.82 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  41.79 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  32.86 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.58 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.03 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  38.16 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  32.47 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9857  Tat family transporter: protein export (chloroplast membrane protein HCF106C)  46.77 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.309601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  40.3 
 
 		 184 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  36.84 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.48 
 
 		 208 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.31 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  35.53 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  31.58 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  57.89 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  34.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  34.21 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>