More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0226 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
91 aa  179  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  70.13 
 
 
104 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  61.25 
 
 
90 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.95 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  83.64 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  83.64 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  53.33 
 
 
87 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  62.5 
 
 
77 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  69.64 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  56.52 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  45.88 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  62.96 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  57.63 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  52.86 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  41.38 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  44.09 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.27 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  54.55 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.77 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.56 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  61.36 
 
 
59 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.91 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.91 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
207 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  56.82 
 
 
60 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  63.41 
 
 
55 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.09 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  47.17 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  49.09 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.09 
 
 
64 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.73 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.76 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  54.76 
 
 
84 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9857  Tat family transporter: protein export (chloroplast membrane protein HCF106C)  46.88 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.309601  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  44.83 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  42.42 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  54.55 
 
 
55 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  52.27 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  43.86 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  44.78 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  53.49 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  57.14 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.37 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.54 
 
 
55 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  53.06 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.49 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.08 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0605  twin arginine-targeting protein translocase  56.72 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.178639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.06 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  38.6 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.45 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
59 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.23 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  38.6 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.88 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.6 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
214 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.66 
 
 
55 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  38.81 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  42.59 
 
 
60 aa  52  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.52 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.08 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  42.17 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.76 
 
 
69 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  46.3 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
77 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.92 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  36.05 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  41.82 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.92 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.92 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  34.33 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
56 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  52.94 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  36.36 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>