156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0076 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
189 aa  361  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.82 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.82 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.82 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.19 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  34.72 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  29.14 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.82 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  24.03 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  30.87 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  25.17 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  25.17 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  25.17 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  25.17 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.23 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.78 
 
 
96 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.78 
 
 
96 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.9 
 
 
140 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  40.28 
 
 
133 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.14 
 
 
116 aa  58.2  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.21 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  37.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  41.67 
 
 
132 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.9 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  40.28 
 
 
132 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  35.82 
 
 
231 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.28 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  36.49 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  54.76 
 
 
123 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.74 
 
 
88 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.25 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40.58 
 
 
104 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.28 
 
 
99 aa  54.7  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  35.82 
 
 
229 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.33 
 
 
128 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  34.29 
 
 
103 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  46 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
113 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.85 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  32.43 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  53.66 
 
 
142 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.67 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  27.22 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.42 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  34.33 
 
 
125 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 
122 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.07 
 
 
96 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  41.46 
 
 
111 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0062  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.6 
 
 
118 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.026501  normal  0.0479583 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  48.78 
 
 
132 aa  50.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  37.93 
 
 
84 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  30.99 
 
 
104 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.78 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  46.51 
 
 
60 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  35.29 
 
 
129 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.78 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  42.42 
 
 
110 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  38.98 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
96 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.5 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  38.98 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  26.67 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  35.29 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.1 
 
 
90 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  31.15 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  34.48 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.16 
 
 
69 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  35.53 
 
 
110 aa  48.5  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.07 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 
88 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.22 
 
 
120 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  30.65 
 
 
88 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.36 
 
 
254 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  33.78 
 
 
102 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1655  sec-independent translocase  45.28 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  30.65 
 
 
96 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  30.65 
 
 
436 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  31.37 
 
 
95 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  46.34 
 
 
56 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  32.84 
 
 
91 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  32.31 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  46.51 
 
 
66 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.93 
 
 
58 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.93 
 
 
58 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.31 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  30.65 
 
 
88 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  51.35 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.13 
 
 
92 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  32.84 
 
 
91 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>