131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1459 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  100 
 
 
65 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.63 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.41 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  54.24 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.9 
 
 
63 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  49.12 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.78 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.17 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.18 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  59.68 
 
 
71 aa  58.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  56.14 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  55.36 
 
 
65 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.9 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  53.45 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.41 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.64 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  59.26 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.86 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  44.64 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 
55 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  58.97 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.76 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.86 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  54.76 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.78 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  51.85 
 
 
59 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.41 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  49.02 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.07 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  39.29 
 
 
89 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.66 
 
 
69 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  41.07 
 
 
67 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  61.76 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  31.58 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.11 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.58 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  53.85 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.6 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  40.74 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  37.93 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0605  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.178639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4596  twin arginine-targeting protein translocase  49.02 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.341736  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  46.3 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.86 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1088  Sec-independent protein translocase, MttA/Hcf106 family  65.71 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.502554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.29 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1969  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  42.11 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1024  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.08 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02885  hypothetical protein  57.58 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1310  twin arginine-targeting protein translocase  86.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  36.54 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1191  twin arginine-targeting protein translocase  86.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0553  twin arginine-targeting protein translocase  86.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.459235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.88 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.40377  hitchhiker  0.00000044122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.66 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.76 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.18 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  43.4 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  37.04 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>