97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2203 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  100 
 
 
141 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  79.02 
 
 
142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  68.79 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  68.79 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  68.79 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.34 
 
 
160 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  66.43 
 
 
131 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  44.68 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  44.06 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  42.55 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.57 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.89 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.97 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  29.08 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.6 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.71 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  27.66 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  27.66 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  27.66 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  27.66 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.75 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  26.95 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.91 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  35.8 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  35.16 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.36 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  35.11 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  40 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.71 
 
 
208 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  40.32 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.46 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  34.25 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  28.33 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  39.66 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.78 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.51 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  32.53 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.97 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  35.29 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  34.15 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  40.23 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  26.8 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  34.52 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  32.58 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  32.14 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  29.84 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.23 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  33.8 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  34.43 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  51.22 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  36 
 
 
133 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  37.88 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.89 
 
 
102 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.05 
 
 
234 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
188 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.17 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  37.1 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  29.67 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.35 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.07 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  34.67 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  30.99 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  31.34 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.33 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.69 
 
 
214 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.61 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.73 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  28.12 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  27.87 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  22.86 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.42 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  37.08 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  32.39 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  27.87 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  29.55 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  36.76 
 
 
172 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  28.85 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.78 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  29.55 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  31.75 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  29.69 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  35.29 
 
 
182 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>