109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4078 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  73.33 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  60.49 
 
 		 179 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  43.9 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  51.52 
 
 		 194 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.58 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  41.07 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.8 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.83 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.9 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  33.68 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  32.98 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  29.77 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  51.79 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.89 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  31.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  42.25 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  32.97 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  31.13 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  31.13 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  31.13 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.12 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.84 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.94 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  34.19 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.58 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  36.47 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.98 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.65 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.98 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.98 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  27.82 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.99 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.44 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  36.07 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  30.43 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  29.63 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.21 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  29.13 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  40 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.72 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.31 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 		 234 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.91 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  37.25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  34.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  30 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.8 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.77 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  32.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.3 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  35.42 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.92 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  31.03 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  38.3 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.24 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  38.3 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  32.88 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.91 
 
 		 198 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.26 
 
 		 125 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.78 
 
 		 77 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  30.91 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.11 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  27.63 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  30.91 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>