69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1070 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  64.29 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  60.61 
 
 		 142 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  58.82 
 
 		 141 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  58.59 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  58.59 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  58.59 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  42.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  41.51 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  58.06 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  27.42 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.69 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  33.71 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  35 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.98 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.22 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  46.3 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.56 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.91 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  30.43 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  32.89 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.48 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  26.72 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  34.72 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  25 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  27.62 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  27.62 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  27.62 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  27.62 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  26.36 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  27.96 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.68 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.44 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  36.36 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  31.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.45 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  23.27 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  35.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.83 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  27.48 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  33.93 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.1 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  27.85 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.98 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.82 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  35.06 
 
 		 125 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.82 
 
 		 139 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  35.06 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.91 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.34 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  35.06 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.85 
 
 		 208 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  26.67 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.47 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>