206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3012 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
120 aa  239  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  67.48 
 
 
123 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  45.83 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50.81 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  61.25 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  45.53 
 
 
112 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  56.58 
 
 
194 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.8 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  40.65 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  33.58 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  33.85 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  32.85 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  44.05 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  42.86 
 
 
128 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  39.76 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  39.76 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  39.76 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  40.96 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.7 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.76 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.55 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  39.45 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.21 
 
 
231 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.94 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  38.55 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  32.67 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  33.03 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.94 
 
 
214 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.22 
 
 
189 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  47.5 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  30.43 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  29.91 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  28.12 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  28.99 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  46.15 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.71 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  29.41 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  34.75 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  36 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.51 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.64 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  39.34 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  28.32 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.85 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.85 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  35.29 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  42.59 
 
 
229 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  42.59 
 
 
231 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.18 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.35 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  48.78 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  48.78 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  36.73 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  37.04 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.22 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  38.24 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  40.98 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  40.98 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  31.46 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  51.35 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.67 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  40.98 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  27.47 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.74 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  51.35 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
234 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  40.98 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  31.46 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  40.98 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  27.47 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  39.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>