133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0601 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  100 
 
 
119 aa  231  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  38.33 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  45.98 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  48 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.07 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  33.9 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  34.92 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.19 
 
 
102 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.84 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  32.54 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  35.79 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  39.56 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  36.36 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  36.36 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  36.36 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  28.68 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.54 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  38.64 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  39.62 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.71 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  31.46 
 
 
229 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  40.79 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  39.62 
 
 
231 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  41.46 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.62 
 
 
254 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  39.47 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  32.65 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.94 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  35.29 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.05 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.9 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.17 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.4 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  30.23 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  31.58 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.17 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  32.88 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 
190 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.58 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  27.59 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  35.38 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.85 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  31.17 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  34.21 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  35.38 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  31.17 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  33.96 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.89 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.25 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.73 
 
 
214 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.33 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.75 
 
 
208 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  33.96 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  31.58 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.61 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  34.21 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.43 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.07 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.85 
 
 
234 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.12 
 
 
231 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  31.58 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.42 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  27.78 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.41 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  32.43 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  42.86 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  27.59 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  32.47 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  33.96 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.19 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  26.17 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.19 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  26.17 
 
 
175 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>