190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1772 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  100 
 
 		 150 aa  289  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.32 
 
 		 193 aa  94.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  45.12 
 
 		 200 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.78 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.24 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  41.94 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.78 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.78 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.78 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  41.24 
 
 		 180 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.39 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  53.12 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  41.11 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  48.57 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  48.53 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.47 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  48.44 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  35.82 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.64 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.95 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  53.7 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.83 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  37.14 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.31 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  37.23 
 
 		 316 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  35.71 
 
 		 203 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  50.91 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  35.71 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  39.29 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  31.91 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  50.91 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  29.5 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.39 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.09 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  37.5 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  27.97 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  40.3 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  29.35 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  29.35 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  29.35 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  29.35 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.05 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.35 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.48 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  43.64 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  32.84 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.92 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  34.38 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  44.26 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  36.7 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.54 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  32.84 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  32.84 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  28.7 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  49.28 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  34.26 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.28 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.1 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  37.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.18 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  38.2 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.68 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  28.37 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  33.62 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  34.45 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  32.05 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  38.2 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  39.66 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  43.14 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  46.15 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  32.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.62 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  41.98 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  32.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  35.09 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  32.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  32.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5067  sec-independent translocase  39.53 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  46.67 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>