150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1165 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  100 
 
 		 222 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  51.83 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  72.32 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  69.16 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  58.16 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  43.59 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  50.4 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  50.4 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.9 
 
 		 159 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.9 
 
 		 153 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.9 
 
 		 153 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.64 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.32 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  48.89 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  42.39 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  40.38 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  53.62 
 
 		 155 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  42.55 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  38.98 
 
 		 180 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  45.98 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.15 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.11 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  47.14 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.64 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  40.3 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.3 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.94 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  32.89 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  31.9 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  31.25 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  34.94 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.3 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.99 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  26.52 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  26.52 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  26.52 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  26.52 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  28.04 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  30.19 
 
 		 104 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.31 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.55 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  26.81 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.25 
 
 		 133 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  30.69 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  39.06 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  46.34 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.62 
 
 		 103 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  30.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  34.15 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.34 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.62 
 
 		 126 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 99 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.51 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.76 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.18 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.14 
 
 		 140 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.74 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  26.17 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  29.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.81 
 
 		 88 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 		 111 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  27.05 
 
 		 164 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  33.72 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.06 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  43.75 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.31 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  32.39 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.73 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  27.82 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.14 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.94 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  34.25 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  27.27 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  29.13 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  31.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  33.33 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  35.94 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.92 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.93 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  27.73 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>