177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1805 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  100 
 
 
201 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  59.05 
 
 
206 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  49.58 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  49.58 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  45.6 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  51.47 
 
 
316 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  52.73 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  57.58 
 
 
208 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.55 
 
 
169 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.64 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.71 
 
 
157 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.2 
 
 
153 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.2 
 
 
153 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.47 
 
 
159 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  54.29 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  52.86 
 
 
172 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  44 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  51.43 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  49.3 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  52.11 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.74 
 
 
146 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  53.23 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.83 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  39.29 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.65 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  50.79 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.48 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  46.77 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.82 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.3 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  33.87 
 
 
120 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  28.46 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.21 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  36.71 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  30.95 
 
 
155 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  31.82 
 
 
137 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  38.03 
 
 
134 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  39.68 
 
 
104 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  31.06 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  31.9 
 
 
147 aa  55.1  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  38.1 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.6 
 
 
122 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 
99 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  36.76 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 
96 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 
126 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  28.26 
 
 
125 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  51.95 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 
152 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.95 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  32.91 
 
 
179 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.1 
 
 
169 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  31.37 
 
 
164 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  31.78 
 
 
160 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.62 
 
 
127 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 
111 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
193 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  26.88 
 
 
133 aa  51.2  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  26.61 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  32.77 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.79 
 
 
88 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  30.32 
 
 
132 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.77 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.03 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  31.03 
 
 
103 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  33.66 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  32.98 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  27.21 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  33.06 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  33.67 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  31.71 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.25 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  34.43 
 
 
132 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.91 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  31.4 
 
 
139 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  34.78 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.22 
 
 
254 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  32.53 
 
 
123 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  30.89 
 
 
170 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.67 
 
 
155 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.24 
 
 
146 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  34.15 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  23.13 
 
 
148 aa  48.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  34.78 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  30.69 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  30.88 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.51 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  39.13 
 
 
175 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  27.52 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  22.58 
 
 
171 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  27.45 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.67 
 
 
128 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>