163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0707 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  81.41 
 
 		 160 aa  260  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  73.33 
 
 		 152 aa  223  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  66.67 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  71.15 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  68.59 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  67.95 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  66.46 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  64.9 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  57.23 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  53.09 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  48.47 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  51.23 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  49.41 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  49.41 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  49.41 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  48.28 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  47.13 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  47.13 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  47.13 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  47.65 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  49.37 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  48.08 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  49.36 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  44.07 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  44.44 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  44.19 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  44.97 
 
 		 172 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  43.86 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  47.17 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  45.34 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  60.26 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.45 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  55.17 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  50.6 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  46.84 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  50.82 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.69 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  39.51 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.19 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  32.14 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  44.26 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  34.04 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.24 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.97 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.8 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.52 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  37.93 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.8 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.04 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.73 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  42.47 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  36.25 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  39.39 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  39.71 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.53 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  41.18 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  38.89 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.81 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.89 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.93 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.82 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  36.07 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.07 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.73 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  36.07 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  39.06 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.86 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  36.07 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  31.13 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  32.63 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  37.84 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.93 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.18 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.18 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  43.55 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  42.5 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  34.43 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.06 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.86 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  40.38 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>