147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0116 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  100 
 
 		 158 aa  321  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  87.97 
 
 		 158 aa  270  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  46.39 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  46.39 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  43.12 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  47.13 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  45.34 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  43.51 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  46.5 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  42.86 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  46.5 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  41.1 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  40.79 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  43.42 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  40.79 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  41.51 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  40.49 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  41.46 
 
 		 176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  41.92 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  42.17 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  40.85 
 
 		 176 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  40.12 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  40.12 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  41.51 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  39.18 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  41.36 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  39.88 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  39.18 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  39.18 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  39.18 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  39.77 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  54.55 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.72 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  50.65 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  40.57 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  43.53 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  44.29 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.82 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32 
 
 		 234 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.67 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  31.08 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.87 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  42.65 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  31.08 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  30.69 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  42.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  39.58 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  40.7 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.96 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.96 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  37.5 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.53 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  38.71 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.36 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  39.71 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  32.14 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  39.13 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  39.34 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  32.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.15 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.85 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.85 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  27.01 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  32.47 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.65 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  38.6 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.62 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25 
 
 		 254 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  33.68 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.95 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.62 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  38.81 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  46.81 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  33.85 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  33.85 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  33.85 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.96 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  38.18 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>