142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1607 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  55.7 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  55.7 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  52.98 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  53.42 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  52.44 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  54.27 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  54.72 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  48.47 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  52.2 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  50.3 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  51.22 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  53.21 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  51.59 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  50.96 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  47.56 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  49.08 
 
 		 172 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  48.19 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  49.7 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  47.34 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  47.59 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  47.62 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  47.62 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  47.62 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  47.62 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  45.66 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  49.7 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  49.7 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  49.7 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  47.59 
 
 		 175 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  45.61 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  45.61 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  45.61 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  45.35 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  41.03 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  40.49 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  50.65 
 
 		 120 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.43 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  43.16 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  38.39 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  46.84 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.88 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  34.58 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.86 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  33.03 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  32.41 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.42 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40.58 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  40 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  40.28 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.36 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  27.84 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  35.82 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  35.82 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.92 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  43.08 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  27.27 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  40.68 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.9 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.67 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  40.98 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  34.52 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.97 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  25.37 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.51 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.85 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.87 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.85 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  56.41 
 
 		 110 aa  51.6  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  26.37 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.14 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.14 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0211  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36 
 
 		 239 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.93 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.19 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.14 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.18 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.81 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  32.71 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  31.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.41 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  38.33 
 
 		 102 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.62 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.36 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 		 116 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  29.27 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.9 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.1 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>