159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0745 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  100 
 
 
159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  99.37 
 
 
159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  77.44 
 
 
164 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  75.46 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  76.43 
 
 
160 aa  236  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  73.42 
 
 
154 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  69.81 
 
 
152 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  68.59 
 
 
155 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  62.89 
 
 
154 aa  204  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  60.12 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  55.7 
 
 
162 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  57.14 
 
 
168 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  51.79 
 
 
175 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  54.66 
 
 
172 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  54.17 
 
 
176 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  51.48 
 
 
176 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  51.79 
 
 
175 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  54.66 
 
 
168 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  53.09 
 
 
170 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  51.79 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  51.79 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  52.56 
 
 
170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  50.89 
 
 
175 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  53.01 
 
 
172 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  50.6 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  50.6 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  50.6 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  50.6 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  50.3 
 
 
178 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  50 
 
 
182 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  48.84 
 
 
179 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  48.84 
 
 
179 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  48.84 
 
 
179 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  52.07 
 
 
175 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  43.51 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  44.16 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  47.32 
 
 
120 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  52.81 
 
 
147 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  48.84 
 
 
118 aa  91.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  50.63 
 
 
149 aa  87  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  54.1 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.28 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  36.17 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  40.21 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  47.54 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  45.9 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  47.54 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.56 
 
 
254 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.56 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  32.14 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  37.89 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  35.05 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  44.44 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  41.67 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.48 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.47 
 
 
173 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.76 
 
 
96 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.76 
 
 
96 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.07 
 
 
96 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  40.28 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.3 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.24 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  28.78 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.82 
 
 
208 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.53 
 
 
117 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  38.33 
 
 
125 aa  54.3  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.96 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  37.33 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  37.7 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.43 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  41.27 
 
 
126 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  34.94 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  29.89 
 
 
132 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.46 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  39.39 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.82 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.7 
 
 
106 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 
122 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2658  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.96 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3049  twin-arginine translocation protein TatB  30.77 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  36.56 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.29 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.21 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.07 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 
91 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.45 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  53.85 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  43.55 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  32.29 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.84 
 
 
113 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>