167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3709 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  98.03 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  81.65 
 
 		 159 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.21 
 
 		 198 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  78.95 
 
 		 173 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  71.15 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.57 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  55.71 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  50.67 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  43.62 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  49.37 
 
 		 180 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  52.86 
 
 		 178 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  52.78 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  42.27 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  49.3 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  42.27 
 
 		 208 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48 
 
 		 208 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  41.24 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.43 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  44.9 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  47.06 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  38 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.53 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  42.71 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  39.8 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.43 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  39.8 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  32.68 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.14 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  45.31 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  38.16 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  38.82 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.42 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  36.84 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  43.94 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.6 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  35.24 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.68 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  36.11 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  35.53 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.17 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  36.99 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  35.62 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  36.49 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  36.49 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  35.62 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  36.84 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  28.21 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  34.67 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.67 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  36.84 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  40.26 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  28.77 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  41.67 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  36.49 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  36.49 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  49.28 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.28 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  42.19 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  35.14 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.84 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.69 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.35 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  25.66 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  29.91 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  32 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  32 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  27.14 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  32 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  32.84 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.84 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  23.84 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  25.5 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  30.36 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  32 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  27.78 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  32 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  25.5 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>