167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3548 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  94.29 
 
 
175 aa  332  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  79.78 
 
 
182 aa  293  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  73.71 
 
 
175 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  72.73 
 
 
176 aa  253  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  70.95 
 
 
179 aa  251  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  70.95 
 
 
179 aa  251  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  72.16 
 
 
176 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  70.95 
 
 
179 aa  251  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  68.11 
 
 
178 aa  247  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  71.59 
 
 
175 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  69.32 
 
 
175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  68.75 
 
 
175 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  68.75 
 
 
175 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  68.18 
 
 
175 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  68.18 
 
 
175 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  68.18 
 
 
175 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  68.18 
 
 
175 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  54.07 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  54.88 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  53.8 
 
 
168 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  52.1 
 
 
170 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  51.5 
 
 
170 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  53.01 
 
 
159 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  51.2 
 
 
170 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  52.41 
 
 
159 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  51.22 
 
 
164 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  48.8 
 
 
160 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  49.08 
 
 
162 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  48.8 
 
 
165 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  50.3 
 
 
152 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  47.02 
 
 
154 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  44.97 
 
 
155 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  42.59 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  42.77 
 
 
158 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  41.51 
 
 
158 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  48.96 
 
 
149 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42 
 
 
163 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41.23 
 
 
120 aa  97.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  50.6 
 
 
147 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  42.27 
 
 
118 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  43.04 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.24 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  41.94 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  41.79 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.79 
 
 
128 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.86 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  41.25 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  41.18 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.01 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.89 
 
 
96 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.89 
 
 
96 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.96 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.94 
 
 
234 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.46 
 
 
96 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.59 
 
 
132 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  31.85 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  30.59 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  37.65 
 
 
133 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  35.44 
 
 
200 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  35.11 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  64.1 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.31 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  32.58 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.79 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.66 
 
 
113 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.3 
 
 
122 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  35.44 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  34.94 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  40 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  61.54 
 
 
110 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.66 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  35.53 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.68 
 
 
116 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  31.63 
 
 
125 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 
126 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35 
 
 
155 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5156  sec-independent protein translocase TatB  35.29 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  34.02 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2611  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.83 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0405955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 
198 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  32.58 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  36.9 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  55.74 
 
 
119 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.27 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  26.03 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.82 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  26.03 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  26.03 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5808  sec-independent translocase  60.98 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.32 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>