199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5808 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5808  sec-independent translocase  100 
 
 
141 aa  273  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66970  sec-independent translocase  98.89 
 
 
141 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440362  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5067  sec-independent translocase  65.03 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5156  sec-independent protein translocase TatB  61.44 
 
 
153 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0383  sec-independent translocase  92.59 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0381  sec-independent translocase  81.32 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685504  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4891  sec-independent translocase  86.75 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.354737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5017  sec-independent translocase  85.54 
 
 
125 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0448  sec-independent translocase  86.59 
 
 
122 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379662  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  62.1 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.68 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.73 
 
 
128 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  37.24 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  47.67 
 
 
231 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  38.06 
 
 
229 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  45.71 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  38.89 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.46 
 
 
234 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.1 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  49.18 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  47.54 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.02 
 
 
254 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  36.97 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.45 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  37.04 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  37.04 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  36.59 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  49.18 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  35.19 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.26 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.26 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  32.37 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  32.37 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  32.37 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.38 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.41 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.18 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  51.67 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
208 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  33.59 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  51.67 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.03 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.03 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.03 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  51.67 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.03 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.32 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  36.9 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  49.18 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  31.37 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  49.18 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  47.54 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.21 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  50.82 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  35.14 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.69 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  50 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  44.26 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.03 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  49.21 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.03 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  46.03 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  34.51 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  37.5 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  30.97 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  37.5 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  33.66 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  42.62 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.65 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  42.62 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  37.5 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  42.62 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.21 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  42.62 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.03 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  42.62 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  39.44 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>