202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0381 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0381  sec-independent translocase  100 
 
 		 148 aa  290  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685504  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5156  sec-independent protein translocase TatB  62.58 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0383  sec-independent translocase  61.21 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5067  sec-independent translocase  61.33 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5808  sec-independent translocase  87.8 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66970  sec-independent translocase  83.33 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0448  sec-independent translocase  85.37 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4891  sec-independent translocase  85.37 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.354737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5017  sec-independent translocase  84.15 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  62.39 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  81.58 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  37.16 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.55 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  40.18 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.3 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  33.58 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  38.83 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.3 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  49.18 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.78 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  49.18 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  49.18 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.33 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.96 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  36.07 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.96 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  37.07 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  35.51 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  38.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  35.77 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  35.34 
 
 		 179 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  35.34 
 
 		 179 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  35.34 
 
 		 179 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  54.1 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  37.07 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.14 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  54.1 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  36.59 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  36.59 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.35 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  37.6 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  46.15 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  34.82 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.42 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.19 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.11 
 
 		 208 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  43.53 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  29.94 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  43.21 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  50.82 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.37 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  58.46 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  36.27 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  34.82 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  31.93 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  35.24 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.47 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.05 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  34.95 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  34.95 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  29.41 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.08 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  28.57 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  32.22 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.69 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.73 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  35.37 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  32.8 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  37.88 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>