84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2609 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  30.68 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  46.15 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  36.92 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  42.37 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  38.46 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.9 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.89 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  28.89 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  32.39 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  35 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  33.85 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  40.38 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.62 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  32.39 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  34.62 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  40.38 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  38.46 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  40.38 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  38.46 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  47.62 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.24 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  37.25 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  23.81 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  26.42 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  36.54 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  30.3 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  30.3 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  36.54 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.54 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.26 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  28.79 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  23.81 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  32.69 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.31 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  30.77 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  38.71 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  34.62 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.69 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.69 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  27.87 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  35.09 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.43 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.84 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.38 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.84 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  31.51 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>