112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  321  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.45 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  58.33 
 
 		 137 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  62.64 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.54 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  64.29 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.43 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  41.96 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  55.56 
 
 		 133 aa  88.2  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  45.24 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  30 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  34.38 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  40.85 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.68 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.53 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  43.42 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  38.1 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.12 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  31.03 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.12 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.66 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  44.44 
 
 		 120 aa  50.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 		 208 aa  50.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  35.48 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  29.06 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.76 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.04 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  42.59 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.83 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.08 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  40.74 
 
 		 118 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  33.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  40.74 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  38.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 		 116 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  31.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.62 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.48 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  29.11 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  37.04 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  30.67 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  30.65 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  30.65 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.19 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  30.65 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  52.5 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.5 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  38.89 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.86 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39.68 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  23.26 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.45 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  31.48 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  36.07 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  46.81 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  46.81 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 		 111 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  46.81 
 
 		 172 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  46.81 
 
 		 168 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  34.78 
 
 		 119 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 		 160 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.62 
 
 		 88 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  33.9 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  37.04 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  35.19 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>