112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  48.24 
 
 
137 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.3 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  45 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  38.54 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  39.85 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  38.55 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.16 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.82 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.24 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  44.3 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  40.66 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  28.04 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  34.44 
 
 
194 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  29.08 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.21 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
234 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  42.86 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  25.74 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.47 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  34.67 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.09 
 
 
160 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  38.82 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  25.27 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 
208 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  30.43 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  39.68 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.81 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  28.41 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  38.1 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  31.87 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  38.1 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  28.41 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  38.1 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  27.63 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.62 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  32.35 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  29.17 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.36 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.73 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  31.48 
 
 
103 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  37.5 
 
 
157 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  31.48 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  35 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  35.71 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  34.38 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.56 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.25 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.71 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.31 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.16 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  24.29 
 
 
214 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  30.84 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.5 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.3 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  35.85 
 
 
184 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  24.43 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  41.46 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  41.46 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  25.81 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  41.51 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.84 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 
178 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  31.58 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.46 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  32.81 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  32.91 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  38.33 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  32.69 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.1 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.19 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.63 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  31.25 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  38.33 
 
 
180 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.63 
 
 
146 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  26.96 
 
 
118 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  31.03 
 
 
119 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  36.51 
 
 
170 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  28.79 
 
 
436 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.63 
 
 
139 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  36.51 
 
 
170 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.77 
 
 
63 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.91 
 
 
66 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 
203 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  34.92 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  38.33 
 
 
180 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  36.51 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  28.38 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  34.62 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.41 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  32.26 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  31.75 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>