30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45427 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  100 
 
 
436 aa  895    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.13 
 
 
190 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 
113 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  38.81 
 
 
126 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.23 
 
 
122 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.29 
 
 
140 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 
96 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  29.31 
 
 
179 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.51 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.77 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.38 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  31.51 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  31.51 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  31.51 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  31.51 
 
 
182 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  31.51 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  31.51 
 
 
171 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  32.86 
 
 
103 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.27 
 
 
190 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  32.65 
 
 
173 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.56 
 
 
146 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38 
 
 
193 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.94 
 
 
88 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>