176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0706 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 146 aa  290  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  45.27 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  45.95 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  47.44 
 
 		 179 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  42.17 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  46.91 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  45.21 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.59 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.8 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  36.05 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  34.92 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.9 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  31.13 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  42.37 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  32.56 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  30 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.22 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  31.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.89 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  31.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  31.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  31.31 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  30.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  28.43 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.82 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.36 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  25.56 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  27.78 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  32.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 208 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.6 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  29.17 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  29.86 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  28.47 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  29.07 
 
 		 202 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  28 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  46 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  44.19 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  31.94 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40.62 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41.38 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  32.08 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.97 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.46 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.45 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  28.26 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.54 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  40.58 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.5 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  28.57 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.78 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  40.58 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.85 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.08 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  30.3 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  32.69 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  39.13 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  32.69 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  42 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  37.04 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.31 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.88 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  29.09 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  34.78 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  34.55 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.21 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  32.73 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  28.37 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  39.13 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.33 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  28.99 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  23.58 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>