106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1126 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 120 aa  233  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  46.43 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  47.06 
 
 		 194 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  37.21 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  36.5 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.66 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  32.88 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.64 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  38.46 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  32.12 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  32.12 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  32.12 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  36.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  37.62 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.4 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  31.67 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  37.08 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  37.5 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.3 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  33.07 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.55 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  34.83 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.45 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.43 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  34.35 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  35.96 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  38.18 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  37.65 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.4 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.36 
 
 		 234 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  38.82 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  29.13 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  37.65 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.4 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  33.85 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  38.81 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.76 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  30.77 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.85 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  29.49 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  26.45 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.55 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.17 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.55 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  28.69 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.94 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  31.88 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  32.81 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  34.38 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  31.48 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.9 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  31.03 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  24.79 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  32.08 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  32.08 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  31.48 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  33.85 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.3 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0220  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.68 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.92 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.21 
 
 		 197 aa  42  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  31.58 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  26.44 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  29.49 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  30 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.04 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  41.03 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  32.31 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.17 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.71 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  30.86 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  32.31 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>