31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0713 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  93.48 
 
 		 138 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.27 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  46.43 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  45.68 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  48.75 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.24 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.5 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.78 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  45.78 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  37.62 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.65 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  39.53 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.76 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  34.04 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.71 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  39.47 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.83 
 
 		 234 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  30.56 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  27.94 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  27.94 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  27.94 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.59 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  29.7 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  29.51 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  29.2 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  31.76 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  27.69 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.55 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>