77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7939 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  40.3 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  50 
 
 		 179 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  48.05 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  45.95 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.55 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.59 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.77 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.37 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.17 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.34 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  30.46 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  42.03 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  31.37 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  28.19 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  28.19 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  28.19 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  36.62 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  30.69 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  34.51 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.39 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  33.8 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  28.95 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.21 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  41.46 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 		 231 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.76 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  29.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.36 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  29.73 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.91 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.92 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  31.46 
 
 		 632 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  29.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  29.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  29.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  29.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  28.93 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.07 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  25.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  27.92 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.23 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.07 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  47.37 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.51 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.2 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  26.44 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  31.58 
 
 		 141 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  34.04 
 
 		 135 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  34.04 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.21 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.79 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.04 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  31.17 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.04 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.04 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.63 
 
 		 234 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  32.73 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.61 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>