103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4461 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
66 aa  130  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  64.41 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.46 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.16 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  54.72 
 
 
59 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.87 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  48.08 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  54.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.73 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  49.09 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.63 
 
 
70 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  55.93 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.51 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.79 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.88 
 
 
70 aa  52  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  50 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  45.9 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  55.36 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  47.06 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.16 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  36.51 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02885  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  40.35 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  38 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  44.68 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.54 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  43.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.73 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.78 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.38 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  37.5 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  40 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  41.3 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  36.21 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.32 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  43.9 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4596  twin arginine-targeting protein translocase  45.1 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.341736  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  34 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  45.45 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.73 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  53.66 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.55 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  34 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.04 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.09 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  34.48 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  34.62 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  43.18 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  34.48 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  38 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  33.9 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.02 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  33.33 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  34.48 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  29.82 
 
 
91 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.14 
 
 
71 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
79 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1649  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.3 
 
 
84 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1555  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.45 
 
 
58 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136949  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  47.37 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  36.73 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  36.73 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1230  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.66 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.892691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.22 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.72 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0605  twin arginine-targeting protein translocase  41.03 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.178639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.45 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1267  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.33 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  48.65 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.78 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1969  twin arginine-targeting protein translocase  48.84 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1255  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.86 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.03 
 
 
90 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  38.64 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.62 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>