203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0040 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
74 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
62 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  48.28 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.69 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.69 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.69 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  53.7 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.42 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  44.59 
 
 
73 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  53.19 
 
 
59 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.42 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  52.17 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  43.9 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.16 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.94 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.76 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.29 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  50.91 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  46.88 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  58.54 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  38.36 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  41.89 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.94 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.96 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2435  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.41 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  42.31 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.17 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  38.67 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  46.67 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  46.67 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  55.1 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  38.67 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  41.56 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  38.67 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  44 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.23 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  56.41 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  58.97 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  41.03 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  58.97 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  55.26 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  46.05 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  40.51 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  45.45 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  39.24 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.24 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  53.85 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  39.24 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  39.24 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  44 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.54 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  28.77 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  46.05 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.46 
 
 
103 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  51.06 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  48.84 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.71 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  47.92 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  55.26 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  35.59 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  47.92 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.46 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  31.25 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 
67 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  37.1 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  31.34 
 
 
115 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.62 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.62 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  43.48 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0876  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.51 
 
 
43 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.697469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.32 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>