238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2500 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
94 aa  184  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.71 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  40.28 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.53 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.78 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  38.75 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.96 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  38.37 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  43.84 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.08 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.29 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.55 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.06 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
59 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  49.02 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.3 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.07 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  44.62 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  36.99 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.35 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.58 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.93 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  36.62 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  53.49 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.06 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.06 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.16 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.94 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.67 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
214 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  63.83 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  51.67 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 
55 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  35.23 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.11 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.31 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  47.06 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  57.63 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.41 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  48.89 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  46.81 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.94 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  36.92 
 
 
88 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.67 
 
 
113 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  43.86 
 
 
77 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  38.33 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.76 
 
 
67 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  49.21 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.48 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  31.94 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  45.83 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  30.38 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.82 
 
 
207 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  36.67 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  43.86 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.33 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  54.9 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  42.55 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.57 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0605  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.178639 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.2 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.15 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>