178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3667 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
74 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  69.39 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  69.39 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  57.58 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  79.59 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  56.06 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50.91 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  63.41 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.69 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  59.26 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.82 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.83 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  52.73 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  52.73 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  52.73 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.18 
 
 
103 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.72 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  71.88 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  76.67 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
91 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  49.21 
 
 
88 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.06 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.1 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.76 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  45.1 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  43.4 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.64 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.28 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  42.86 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.3 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.64 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  73.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.1 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  51.22 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  54.76 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  43.48 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.28 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  41.3 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  61.11 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  58.7 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.94 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 
58 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.5 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 
58 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
62 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39.39 
 
 
103 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.89 
 
 
87 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  51.02 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.9 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  36.96 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.21 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  56.76 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  36.96 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  33.78 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  41.07 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  33.96 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  33.78 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  33.78 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.32 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  38.36 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  42.86 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.85 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  41.18 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  32.43 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  36.36 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.94 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.43 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.34 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.94 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.29 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  29.23 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.29 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  36.36 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.29 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.98 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>