204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  100 
 
 
95 aa  183  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.74 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  49.21 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  51.61 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.58 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  50.85 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  50.85 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  50.85 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  67.24 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  71.43 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.94 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  73.47 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  43.84 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.86 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.74 
 
 
81 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  41.76 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.56 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  66 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  55.32 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  64 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.3 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  43.33 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  59.52 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.94 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.47 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  48.98 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.86 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  76.67 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  36.71 
 
 
85 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  36.71 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  56.25 
 
 
107 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 
82 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.46 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.02 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  39.74 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  37.68 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.86 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  38.64 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  33.7 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  38.6 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  64.52 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  33.7 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.28 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  33.7 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  34.43 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  36.96 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  40.32 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  45.24 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  32.98 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  32.14 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  35.62 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
76 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>