113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2169 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 		 83 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  52.7 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  50.72 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  48.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  48.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  48.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.85 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50.94 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  63.41 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.73 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  63.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.29 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  63.16 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  49.21 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.16 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.54 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  46.34 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.71 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.06 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.73 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  43.24 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  71.43 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.21 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.78 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  40.54 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.14 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  47.27 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  62.86 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  46.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  45.61 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00933291  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.71 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  38.71 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  33.8 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  33.75 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  30.86 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  33.87 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  33.87 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  39.29 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  30.86 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14010  Sec-independent protein secretion pathway component  50 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143523  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  36.23 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  34.52 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  38.24 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.29 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  79.17 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  32.39 
 
 		 73 aa  43.9  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  41.82 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.35 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  36.54 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  30.49 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  32.91 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  46.77 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.12 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.88 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.88 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.75 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  30.77 
 
 		 73 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  32.84 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.58 
 
 		 103 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  41.46 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.1 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  29.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.43 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  59.38 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  34.25 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>