85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1503 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  53.4 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.18 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.26 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.56 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  67.39 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.04 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.75 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  65.22 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  56.52 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  61.82 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  43.55 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  59.68 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  62.16 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  62.16 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  62.16 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  48.21 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.29 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  32.43 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.76 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.59 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.77 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  56 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.72 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  40 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60.98 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
56 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  30.14 
 
 
73 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.88 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
55 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  29.33 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.34 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  29.33 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  42.31 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.1 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  43.24 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  54.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.33 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  74.07 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  43.24 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  43.24 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  43.24 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  61.29 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.18 
 
 
84 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 
122 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  37.5 
 
 
83 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.48 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14010  Sec-independent protein secretion pathway component  73.91 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143523  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.29 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  31.08 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1104  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
50 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  41.38 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  55.56 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.03 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.62 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.24 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  46.51 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 
81 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.94 
 
 
89 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>