78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6972 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.14 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  53.57 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  38.75 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  38.75 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  38.75 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  41.03 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.19 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.77 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.35 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.86 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  53.57 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  36.92 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.78 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.06 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  64.86 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.7 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  43.08 
 
 
107 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  52.94 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  53.49 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.64 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  37.04 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  28.05 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  46.51 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  53.49 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.14 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.59 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  31.88 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  31.82 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.82 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.57 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  31.82 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.16 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
94 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.78 
 
 
56 aa  46.2  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.14 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  32.73 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.31 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  35.19 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  29.73 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.07 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  29.17 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  46 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  34.21 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  76 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  34.62 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.62 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  33.9 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  30.65 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.58 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  27.85 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  41.03 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  31.58 
 
 
73 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.09 
 
 
58 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  30.61 
 
 
82 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.09 
 
 
58 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.59 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  35.56 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.82 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  32.2 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  43.9 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  41.03 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.55 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  25.64 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  29.03 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>