202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0706 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  82.56 
 
 
83 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 
82 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  70.24 
 
 
82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  70.11 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  67.47 
 
 
79 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  59.52 
 
 
77 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  58.43 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  58.43 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0841  twin arginine translocase protein A  70.24 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  58.14 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  64 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  60 
 
 
78 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 
73 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  56.47 
 
 
76 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  61.33 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  65.28 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  66.67 
 
 
77 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  58.02 
 
 
73 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  54.76 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  55.95 
 
 
79 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  58.02 
 
 
73 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0701  twin arginine-targeting protein translocase  62.65 
 
 
74 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  54.41 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  71.74 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  67.92 
 
 
54 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  51.9 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  53.95 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0913  twin arginine translocase protein A  61.45 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.29 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  54.29 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  54.29 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  54.29 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  52.86 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  54.93 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  51.85 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  47.62 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  52 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.84 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  59.26 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1704  twin arginine translocase protein A  82.22 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  46.99 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0810  twin arginine-targeting protein translocase  56.96 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  44 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  60 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.38 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  57.41 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2000  twin arginine translocase protein A  57.81 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.238587  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2956  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.447023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2303  twin arginine translocase protein A  49.35 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216844  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  43.04 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0714  twin arginine translocase protein A  52.05 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.1 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1776  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  53.85 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  37.65 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0117  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.48 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.321462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  43.24 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1608  twin arginine translocase protein A  51.85 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.28 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  40.28 
 
 
77 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0219  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.24 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0458  twin arginine-targeting protein translocase  52.05 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1586  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 
89 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.481471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  52 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  52 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  52 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>